睡醒手指头疼可能有以下几种原因：

第一、腱鞘炎，腱鞘炎患者常出现一个手指关节的掌侧的疼痛，在睡醒之后可以出现疼痛、僵硬的症状，严重者可以伴有弹响以及手指活动受限，这时要进行早期的查体进行诊断，必要时进行封闭以及手术治疗。

第二、类风湿性的疾病，类风湿性关节炎患者也可以出现睡醒之后手指关节的疼痛，常为多发、双侧对称性的发病，这时要早期的进行血的化验以及手的X线片检查，来进行早期的诊断和早期的治疗。

第三、强直性脊柱炎，如果强直性脊柱炎病情严重，也可以累及手指，可以出现睡醒之后手指疼的症状，这时要进行手指关节的X线片以及血的化验、骶髂关节X线片检查，来进行诊断和治疗。