肺炎的药物治疗主要是抗感染、止咳、化痰等治疗。抗感染治疗，需要明确是哪一种病原体感染。病毒性肺炎需要予以奥司他韦、帕拉米韦抗病毒。细菌性肺炎则可予以青霉素类、头孢类抗菌治疗。支原体肺炎则需要使用阿奇霉素或左氧氟沙星抗感染。真菌性肺炎则需使用大扶康、伏立康唑等抗真菌药物。

肺炎引起的咳嗽，假如为干咳，可以使用甘草合剂、复方福尔可定；若痰液较多，就不适合使用较强的止咳药物，需予以氨溴索、吉诺通等化痰治疗。部分患者可出现气道痉挛，而表现为胸闷、气喘等不适，这时候可以予以博利康尼、普米克令舒等雾化缓解症状。