早孕反应晚上严重的原因有以下几个方面：

1、与人体的生物钟有一定的关系，因为在晚上体内的激素水平和白天会有明显的不同，比如体内的雌激素、性激素、孕激素、黄体生成素、甲状腺激素和去甲肾上腺素等，可以直接或间接作用于女性的生殖系统，从而导致孕反晚上比较严重；

2、因为神经系统的因素，因为女性在晚上有些神经系统的敏感性会增加，这些兴奋的神经可以通过突触而释放神经递质，间接地作用于女性的生殖系统，比如子宫、阴道和输卵管，使这些器官的功能亢进或活跃性增强，也可以导致女性早孕反应在晚上严重。