射精以后肾疼是肾精不足、命门火衰的表现，中医认为腰为肾之府，肾虚则腰痛，这里面讲的肾虚实际上就是肾精亏虚，肾精不足的人通常还表现为神疲乏力、经常头昏、精液稀薄，病人腰痛不仅仅发生在射精以后，着凉以后也会加重。

肾又称作命门，中医认为它里面藏有真火，乃生命之火，命门火旺所以阳事强大，命门火衰就会出现性生活以后腰疼或者平时的时候勃起不坚，而且周身乏力、酸软，这类病人大多都是生活习惯不健康，喜欢熬夜、饮酒、饮食不规律，西医认为这类病人通常是蛋白质摄入不足或者神经衰弱。如果中医治疗这类病人，要求病人改变不良的生活习惯，可以口服右归丸或者金匮肾气丸，改善射精以后腰疼的症状。