环磷酰胺对肾病综合征的作用，主要是抑制免疫炎症的反应，降低尿蛋白、稳定肾功能、延缓肾功能的纤维化以及肾功能衰竭，防止进入到尿毒症期。

环磷酰胺主要适用于激素依赖型，或者激素无效型的肾病综合征患者，主要是协同激素治疗。一般环磷酰胺不作为首选或单独治疗肾病综合征的药物，因为它具有一定的毒副作用，如骨髓抑制、肝脏损害、脱发、化学性膀胱炎、精子缺乏等，这些情况会引起严重的并发症。

因此在临床使用环磷酰胺前，应该对患者病情进行较为详细的评估，必要时可以做肾活检，根据肾活检的病理类型情况，来决定是否使用环磷酰胺或者加用其他药物。