自然状态下，即非人为目的造成的流产称为自然流产，发生在12周以前的流产为早期流产，妊娠12周至不足28周的流产定义为晚期流产。导致自然流产的原因有很多：

一、不健康的生活方式，如酗酒、过量饮用咖啡因以及环境因素等都可能导致流产。

二、遗传因素，染色体异常，包括夫妻染色体异常和胚胎染色体异常。常见的夫妇染色体异常为平衡易位、罗伯逊易位等。

三、母体内分泌失调，表现为黄体功能不全、多囊卵巢综合征、高泌乳素血症、甲状腺疾病以及糖尿病都有可能成为自然流产的原因。

四、母体生殖道的异常。主要包括子宫畸形，如单角子宫、双角子宫、双子宫及子宫纵隔等。人流术后综合征，宫腔粘连、宫腔体积缩小、宫颈机能不全引起晚期流产和早产是导致妊娠中期流产的主要原因。另外，子宫肌瘤黏膜下肌瘤及大于5厘米的肌腱肌瘤与流产有关。

五、母亲全身性疾病，如严重感染、高热疾病、严重贫血或心力衰竭、血栓性疾病、慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病或高血压等均可能导致流产。TORCH感染虽然对孕妇影响不大，但可感染胎儿导致流产。