肠炎、结肠炎的治疗要根据患者的病情，给予个体化、综合化的治疗。一般来说应该尽早的控制患者疾病的症状，促进疾病的缓解，维持治疗，防止复发，防治并发症和掌握合适的手术治疗时机。一般患者要注意休息、防止过劳、进食高营养、易消化的饮食，并且要低脂低渣。重症患者或者伴有巨结肠、肠瘘等并发症的患者，要给予全肠外营养。

药物治疗主要是使用氨基水杨酸类药物，比如柳氮磺吡啶、美沙拉嗪、奥沙拉嗪等，但是要在医生的嘱托下使用。另外，患者可以使用糖皮质激素治疗，常用的药物有强的松、强的松龙，这些都是为抑制溃疡性结肠炎急性活动期炎症的有效药物。如果患者出现大出血、穿孔或者即将穿孔的，要及时的予以手术处理。