胃镜检查能查出幽门螺杆菌，进行胃镜检查时，可以取下部分胃组织进行组织病理活检，从而检测出胃内幽门螺杆菌的含量，但此种检测幽门螺杆菌的方法在临床中并不常用。

进行胃镜检查时，管道进入胃内与外界相通，此时医生可以通过胃镜的管道取出部分胃黏膜组织，然后进行检测。但是此种方法属于有创检查，且具有一定的误差，如果恰好取出的部位没有幽门螺杆菌存在，而胃内其他部位有幽门螺杆菌，便会造成假阴性现象，使检查结果准确性降低。

临床中常用的幽门螺杆菌检测方法是C13或C14呼气试验，如果胃内存在幽门螺杆菌，会释放尿素酶，患者服用C13或C14胶囊后，尿素酶会对C13或C14进行标记，如果患者吹出的气体中含有被尿素酶标记的C13或C14，则代表胃内有幽门螺杆菌感染。此种方式简单、快捷、无创，并且检查结果较为准确，因此在临床中被广泛应用。

需要注意的是，进行C13呼气试验或C14呼气试验前，需要空腹三小时以上，并且在检查前一个月不能服用对检查结果可能产生影响的药物，例如奥美拉唑肠溶胶囊、阿莫西林胶囊等，胃内容物或者药物对检测结果造成影响。