一觉醒来手指关节疼痛可能有以下几种原因：

第一、风湿和类风湿，风湿和类风湿的疾病可以有晨起时手指关节疼痛、僵硬的症状，常累及多个关节，严重者会有关节的畸形，这时要早期的进行血的化验以及手指的X线片、CT的检查，来进行早期的诊断和早期的治疗；

第二、腱鞘炎，如果为一个手指的关节疼痛，常是由腱鞘炎而引起，这时可以出现关节的疼痛，严重者会有肿胀、弹响以及交锁的症状，会有关节活动受限，这时要早期的进行专科的查体以及检查来进行早期的治疗；

第三、强直性脊柱炎，强直性脊柱炎严重时也可以累及手指关节，出现睡醒后关节的疼痛，可以伴有僵硬，活动一会之后就能有所好转，这时要进行血的化验以及手的X线片检查，来进行早期的诊断和治疗。