青蒿素临床上不广泛应用治疗系统性红斑狼疮，青蒿素对于狼疮的治疗，目前仅限于临床药物研究试验阶段，还没广泛推广到临床应用。

对于系统性红斑狼疮，目前治疗手段比较多，包括糖皮质激素以及免疫抑制剂，比如环磷酰胺、吗替麦考酚酯、他克莫司等。系统性红斑狼疮尚不能完全根治，但早期诊断以及正规治疗，大部分病情会得到很好的控制，系统性红斑狼疮患者，应该去风湿免疫科进行科学的治疗，并定期复查，大部分病情会得到控制。