早上起来出现肩膀、脖子酸痛的原因如下：

1、颈椎病、肩周炎，如果睡觉时受凉，可能出现上述症状。颈椎病是非常常见的疾病，是以退行性病变为基础的疾病，颈椎长期劳损、骨质增生或者椎间盘脱出，都有可能引起颈椎功能障碍，从而出现颈部疼痛、四肢麻木等症状；

2、肩周炎，也会出现肩部阵发性疼痛，气候变化、受凉、劳累等原因都有可能引起疼痛加重。

首先要注意休息，避免劳累，还可以通过热敷、针灸、推拿等理疗的方式进行治疗，缓解疼痛的症状。如果疼痛比较明显，可以口服消炎镇痛药进行治疗，缓解疼痛的症状。如果症状仍然不能好转，建议到医院进一步检查，以明确诊断，并进行针对性的治疗。