流感疫苗主要用于预防流感病毒引起的流行性感冒，而新冠疫苗即新型冠状病毒疫苗，通常用于预防新型冠状病毒感染所致的疾病，通常认为儿童接种流感疫苗与新型冠状病毒疫苗的接种间隔在14天以上。

流感疫苗和新型冠状病毒疫苗的主要免疫原理相似，都是通过疫苗刺激人体免疫系统，产生免疫应答，产生有关的抗体和免疫细胞，达到预防疾病的效果。若是同时进行两种疫苗的接种，可能会导致两种不同的疫苗同时刺激人体免疫系统，可能会引起免疫系统功能紊乱，造成免疫应答的混乱，从而减弱疫苗的效果，无法达到预期治疗疾病的目的。所以临床建议儿童在接种完流感疫苗14天之后，再进行新型冠状病毒疫苗的接种。另外，注意儿童应该在完全流感疫苗的全程接种后，即在流感疫苗的最后一针14天后，再进行新型冠状病毒疫苗的接种，不要针次交叉接种。

此外，需要注意的是，目前我国新型冠状病毒疫苗接种人群主要为3岁以上人群，3岁以下的儿童不建议进行接种。同时，若是对新型冠状病毒疫苗过敏、存在严重神经系统疾病、腋下体温大于等于37.3℃，以及其他疾病急性期的儿童也不建议接种。