间充质干细胞对于晚期肝脏疾病、风湿性自身免疫性疾病等具有良好的治疗效果。间充质干细胞是指具有所有干细胞特性的早期非分化细胞，具有自我复制、自我分裂、自我更新和多向分化等特点。

1、晚期肝脏疾病：间充质干细胞可以在受损肝组织中分化成肝细胞样细胞，还可以在受损的肝组织中产生一系列的营养物质。这些物质可以通过调节机体的免疫反应、抗肝细胞凋亡、抗肝纤维化，促进内源性肝细胞增殖，促进血管增生；

2、自身免疫性疾病：包括全身性红斑狼疮、干燥综合征、肌炎、皮肌炎、硬皮病等。间充质干细胞具有调节免疫功能、阻止炎性介质释放的功能，可调节各种免疫细胞，并能抑制免疫系统的过度活动；另外间充质干细胞可分化成新的细胞，以取代受损的细胞，产生各种细胞因子，减少损伤，并对损伤的组织进行修复；

3、其他疾病：包括糖尿病足、动脉硬化闭塞症、血栓闭塞等。间充质干细胞能分化为内皮细胞和平滑肌细胞，并整合到受损的血管丛中，直接分化成熟，形成新的血管。还可以直接分泌细胞因子，如血管内皮细胞生长因子，从而刺激局部缺血组织的血管再生。

间充质干细胞具有神经保护、促进神经再生、调节机体免疫功能，尤其对神经变性、阿尔茨海默症等疾病的治疗具有重要的作用。间充质干细胞可以减少疾病活动度、蛋白尿、血肌酐、尿素氮等指标，使血清白蛋白和补体得到补充，损伤器官得到修复。