引起一上厕所小腹肚子疼的原因较多，如尿道炎、膀胱炎、下尿路结石等。建议及时就医，明确自身病因后，采取针对性的治疗方式缓解自身不适。

1、尿道炎：通常因为不良的性生活、排尿次数过少，导致病菌入侵尿道而引起炎症。炎症可刺激患者的尿道，引起局部组织黏膜水肿，进而引起排尿困难，导致一上厕所小腹疼。建议此类患者遵医嘱使用注射用头孢曲松钠、青霉素V钾片等抗生素类药物，以缓解疼痛等症状；

2、膀胱炎：可能因为性生活、导尿、个人卫生不洁及机体抵抗力降低等因素引起细菌逆行感染，诱发膀胱炎。炎症因子可刺激膀胱，从而引起尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激征，可表现出小腹疼的症状。建议此类患者多饮水，可遵医嘱使用头孢克肟分散片等抗生素类药物进行治疗，缓解炎症刺激；

3、下尿路结石：与营养不良、良性前列腺增生、输尿管结石排入膀胱等因素有关，患者膀胱以及尿道内有结石，可能会导致其尿道堵塞，小便排不出堆积在膀胱内，使患者出现小腹疼痛的现象，在上厕所时该症状加重，进而出现一上厕所小肚子疼的现象，可在医生的指导下进行体外冲击波碎石，还可采取取石手术，从而缓解身体不适；

4、其他原因：若膀胱内部生长息肉、肿瘤，并压迫膀胱周围的神经，可造成泌尿系统紊乱，进而出现一上厕所肚子疼而的现象。

建议在医生指导下进行肿瘤或息肉的切除术，以缓解此类症状。同时建议术后进行病理切片，以明确其良恶性，有利于后续的治疗。