临床上益生菌药物较多，包括双歧杆菌四联活菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等。

1、双歧杆菌四联活菌片：可以补充肠道正常菌群，抑制致病菌，维持正常肠道蠕动，调整菌群平衡。主要用于治疗肠道菌群失调相关的腹泻、便秘、功能性消化不良等疾病；

2、地衣芽孢杆菌活菌胶囊：可促进肠道内正常菌群生长，对致病菌有抑制作用，适用于治疗肠道菌群失调引起的疾病，如细菌或真菌引起的急、慢性腹泻以及急、慢性肠炎等；

3、枯草杆菌二联活菌颗粒：可补充正常生理活菌，抑制肠道内有害细菌过度繁殖，调整肠道菌群，治疗成人急、慢性腹泻。主要用于治疗消化不良、食欲不振、营养不良，以及肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀、肠道内异常发酵、肠炎等，含义使用抗生素引起的肠黏膜损伤等。

此外双歧杆菌三联活菌胶囊、酪酸梭菌活菌片等也属于益生菌药物，使用时需谨遵医嘱，不可擅自用药。