中枢性肺泡通气综合征的发病机制一般有：呼吸控制系统障碍、呼吸感受器功能障碍、对缺氧敏感性低于正常、中枢神经损害和病变。
1、呼吸控制系统障碍：中枢神经系统尤其是大脑脑干神经元功能障碍，是本病最大特点；
2、呼吸感受器功能障碍,对CO2的敏感性降低：位于脑干延髓的化学感受器依赖于高碳酸血症的代谢性呼吸控制机制。只有当CO2达到一定浓度的高碳酸血症时,才能驱动呼吸反射；
3、对缺氧敏感性低于正常 ：呼吸中枢对缺氧的敏感性较高,是调控呼吸的主要机制,此类病人对低氧血症的反应性降低；
4、中枢神经损害和病变：中枢性肺泡低通气综合征可由感染脊髓灰质炎脑卒中脱髓鞘病等神经系统疾病所继发,也可以是药物因素对中枢神经的损害或促发。
参考资料：[1]钟南山，刘又宁.呼吸病学.第2版[M].北京.人民卫生出版社.2012
