注射乙肝疫苗的不良反应，包括出现红肿、硬结、红斑、疼痛等症状，发生率一般在3-29%左右，偶尔会出现发热，体温大于37.7℃，极少数患者会出现过敏反应。

乙肝疫苗安全有效，保护力强，免疫应答效果较好，在注射第三剂后一个月检测，应答率可达到95%，也有患者免疫应答率较低，例如吸烟史、肥胖、糖尿病患者，对于血液透析、肝肾功能不全的患者，应答率在60-70%。

此外乙肝疫苗的不良反应较少，且应答率高，建议人群接种，尤其是新生儿、儿童、静脉吸毒者、血液透析患者以及艾滋病感染者。