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- 幽门螺杆菌感染及其相关疾病（慢性萎缩性胃炎/肠化、消化性溃疡、胃癌等）；肠道疾病诊治及其内镜操作（不明原因消化道出血、克罗恩病、溃疡性结肠炎、结肠息肉和早癌的内镜下治疗、胶囊内镜、小肠镜等）；功能性胃肠病诊治（功能性消化不良、慢性腹泻、不明原因腹痛/腹胀等）。
- 慢性肝炎、肝纤维化、脂肪肝及肝硬化等肝脏疾病；较系统研究了慢性乙型肝炎、慢性丙型肝炎、肝纤维化及各种类型肝硬化的基础理论、诊断、鉴别诊断及治疗；其次对大肠疾病、胃十二指肠疾病、胰胆疾病及其它消化系统少见疾病亦有较深入的研究。
- 治疗食管、胃、小肠、结肠、直肠所患的消化疾病，比如各个部位的炎症、糜烂、溃疡、息肉、占位、肿瘤等，还包括功能性的胃肠病，如功能性消化不良、肠易激综合征，以及慢性的腹泻等疾病。肝脏疾病，比如慢性肝炎，包括乙型病毒性肝炎、丙型病毒性肝炎，还有肝硬化、酒精肝、原发性肝癌、胰腺癌、胰腺炎、消化道出血等疾病。
- 胆道系统结石病，如肝内胆管结石病、胆囊结石、胆总管结石的微创治疗，胆囊息肉样病变的诊断和微创治疗，胆道系统肿瘤，如肝门部胆管癌、胆管癌和壶腹周围癌的诊断和治疗，以及腹痛待查和各类急腹症的诊断和治疗。
