普外科
上海市第一人民医院普外科创建于1952年，由我国著名的外科学家任廷桂教授（卫技一等1级）创立。在过去70多年中，学科创造了多项第一。现为国家临床重点专科、“211”三期建设项目、国家卫生部腹腔镜诊疗技术培训基地、国家普外科专科医师培训基地、上海市器官移植研究中心、上海交通大学器官移植研究所、上海交通大学胰腺癌诊治中心、上海市胰腺疾病重点实验室。曾是上海市肝脏移植质控中心挂靠单位。
目前，普外中心已形成7个特色亚专科：胃肠外科、结直肠外科、肝胆外科、胰腺外科、甲状腺乳腺外科、血管外科和腹部急重症外科。中心分南北两部共拥有300张床位。正高职称25人，副高职称25人，具有博士学位64人，海外留学经历20人，博士生导师12人，硕士生导师10人，共培养博士及硕士研究生300余人。
近年来，普外科承担和完成国家“十一五”科技支撑计划、国家自然科学基金重大项目、国际合作重大研究项目、国家“863”战略性重点项目、卫生部公益事业专项基金、科技部国家重点研发计划、上海市科委重大研究项目等国家级、上海市级课题120余项，累计总科研经费12000余万元。荣获国家教育部高校科技进步一等奖和上海市科技进步奖一等各奖二项，并拥有15项发明专利。
胃肠外科
胃肠外科是国内最早开展腹腔镜胃癌、结直肠癌根治术的单位之一，积累的病例数处于国内领先水平。同时也是上海最早开展第四代达芬奇机器人胃癌、结直肠癌根治术的单位，积累的病例数处于上海领先水平。建立了规范化和精准化多科室诊治和癌症患者全过程管理体系，以胃肠肿瘤微创手术为主的综合治疗为特色，获得了良好的治疗效果。此外，在肥胖症和Ⅱ型糖尿病的微创手术、腹壁疝微创外科治疗等方面亦具有丰富经验和独特的建树。现已成为国家重点临床专科普通外科的重要亚专业，并且是上海市普通外科机器人手术系统治疗技术质控组长单位、上海市虹口区外科质控组长单位和上海市普通外科胃癌、结直肠癌质控成员单位。
结直肠外科
泌尿肾移植科由我国著名的泌尿外科专家谢桐教授亲手创立，1976年进行首例尸体肾移植获得成功，是国内最早开展肾移植的单位之一。2001年8月经上海市政府批准，成立了上海市器官移植临床医学中心，成为上海市首批12个由政府专项拨款支持建设的临床医学中心之一。目前开展的器官移植包括尸体肾移植、亲属活体肾移植、肝-肾联合移植、胰-肾联合移植、肾-成人胰岛细胞联合移植等，至今累计肾脏移植总数2700余例、年移植量50-100例，最小移植受者11岁、最大移植受者72岁。1年人/肾存活率97.4%/93.2%，5年人/肾存活率86.6%/72.2%，10年人/肾存活率65.7%/55.1%。最长移植肾存活时间已超过40年。
肝胆外科
肝胆外科拥有专科医生18人，其中正高职称6人，副高5人。迄今开展肝移植超1000例，移植疗效居国内领先水平，先后获得上海市科技进步一等奖和教育部科技进步一等奖。每年诊治肝胆恶性肿瘤新患者500例以上，诊治胆囊疾病1500例以上。近年来已成功开展包括全腹腔镜下胰头十二指肠切除、半肝切除在内的各类微创手术，为患者术后快速康复带来福音。积极开展达芬奇手术机器人辅助下的各类肝胆胰脾手术，其中机器人肝肿瘤切除的年手术数量居上海市第一（申康中心统计数据）。
胰腺外科
胰腺外科是依托上海市胰腺疾病重点实验室，聚焦胰腺肿瘤等相关疾病,全面开展各项临床诊疗工作，年平均门诊量约8000人次，年手术量超过1000人次。临床开展胰腺相关的各类手术（包括：胰十二指肠切除联合肝切除、全胰腺切除、保留胰腺功能各类微创手术、巨大腹膜后肿瘤联合脏器切除、胰腺癌根治联合门静脉切除重建等），手术并发症低。同时深入进行科学研究，并积极推进综合诊疗技术和方案的创新和转化，先后承担国家自然科学基金近9项，科技部重点研发计划子课题1项，上海市自然科学基金和申康研究型课题多项。
血管外科
血管外科创建于20世纪90年代，在几代血管外科医生的开拓耕耘下，逐渐形成以主动脉夹层/瘤/狭窄、外周动脉瘤/狭窄、颈动脉瘤/狭窄、动脉硬化性闭塞症、动脉栓塞、布加综合症、深静脉血栓、髂静脉受压综合症、血管损伤、静脉曲张、糖尿病足等血管外科疾病的外科手术、介入和杂交手术治疗的特色专科，并形成市一规范化和精准化治疗体系。每年完成主动脉疾病手术超400台，外周血管手术超1000台。目前是腔内血管外科培训基地及VTE防治中心。
甲状腺乳腺外科
甲状腺乳腺外科每年甲状腺癌手术量超过1500例，手术量居上海市三甲医院前列。现已建立了专科重点病种的多科室诊疗团队（MDT）体系，形成了以乳腺癌个体化手术和综合治疗为主的特色专科。科室积极开展保留乳房的根治性手术及前哨淋巴结活检手术，同时开展即刻乳房重建手术（包括皮下腺体切除联合假体植入术，各种皮瓣修复手术），为女性患者保驾护航的同时更塑造了她们重返社会的信心。近年来团队运用腔镜和达芬奇机器人等技术为乳腺癌患者提供更个体化、微创化和精准化的手术治疗模式，为上海市首个开展机器人乳房重建手术的单位。
腹部急重症外科
腹部急重症外科通过集成外科手术、重症监护、外科救援、损伤控制等先进技术和理念，实现腹部外科急危重症的全链条治疗，具有救治效率更高、并发症和死亡率更低等优势。科室为中国人民解放军联勤保障部队腹部创伤及急重症外科专科联盟成员单位。形成了以肠梗阻的微创及开放手术、肠瘘与腹腔感染、炎症性肠病的综合治疗为主的特色专科。此外，在腹部创伤、腹腔高压、放射性肠损伤、短肠综合征、临床营养支持等方面具有丰富的经验。
