贲门位于食道进胃的部位，贲门癌也称食管-胃交界处癌，广义上贲门癌也属于胃癌，目前大多数人认为虽然遗传因素在贲门癌发病中不如结直肠癌重要。
但贲门癌的家族史仍然可能是危险因素，因为贲门癌有明显的家族聚集倾向，家族发病率高于普通人群的2-3倍。
癌症的家族遗传现象目前认为可能是由染色体的畸变引起，有时会传给遗传给后代，但遗传并不是直接的癌症遗传，而是肿瘤易感性。另外，对血型的研究表明，贲门癌与A型血有一定的联系，但是仅仅是弥漫性的贲门癌有关。
另外，遗传性非息肉性结直肠癌、家族性腺瘤性息肉病以及基因突变与结肠癌有关，目前认为还与胃癌有一定关。