大体上一个活动性的胃溃疡境界清楚，通常为卵圆形或圆形，伴有黏膜皱襞向溃疡边缘集中。显微镜下典型的活动性慢性消化性溃疡有四层特殊结构：一、表层为脓性渗出物、细菌和坏死碎屑；二、纤维素样坏死组织；三、炎性肉芽组织；四、纤维化取代肌层并延伸至黏膜下层，在溃疡边缘，黏膜肌层似乎与固有肌层融合。溃疡底部其他常见的特征有血管内皮下纤维组织增生，导致血管壁增厚和神经束肥大。另外，坏死的表面可以有白色念珠菌感染。