醋酸氯己定溶液的作用有治疗鼻炎、清洁消毒、降低受孕几率、皮肤消毒、口腔清洁等，由于滴虫、淋菌、霉菌或者其他致病菌导致宫颈炎、阴道炎、性病，以及白带增多症等炎症或者疾病，醋酸氯己定都具有一定程度的治疗作用。在妇科手术前、产前、人工流产手术的时候，需要对体表或者阴道进行消毒以及清洁，从而降低手术感染的概率。
房事之前需要洁身防病，降低受孕的概率，也需要用到醋酸氯己定溶液对患者进行口腔清洁，或者针对由于假牙导致的口腔炎，也需要用到醋酸氯己定溶液。醋酸氯己定溶液也可以用于黏膜或者皮肤的消毒，醋酸氯己定溶液主要用途是治疗妇科疾病，通常针对化脓性阴道炎、宫颈糜烂等情况，可以清理保护女性的阴道。