脑囊虫病治疗要根据它的临床表现，因为脑囊虫病有不同的时期，一般在临床上分四个时期，另外，还有不同的类型，如有的是在脑实质、有的是在脑室、有的在脑池，根据它的不同部位，也有不同的分型。脑内的脑囊虫多数是服药治疗，或者叫驱虫治疗，服一些治疗囊虫的药杀死虫子来治疗。如果脑囊虫在脑室或脑池内，虫子可能已经死了，但它造成了炎症反应，引起了粘连、脑积水，这时候的治疗不是治疗虫子，而治疗它引起的这些病，往往是需要手术的。