脑囊肿的手术方法包括：1、开颅手术，即保留脑表面囊壁，切除部分囊壁，弊端是分离过程可能造成损伤而引起癫痫，且术后囊肿易复发；2、分流手术，即用分流管连接囊肿与腹腔，弊端是患者长期带管产生依赖，且易引发并发症；3、内镜手术，为目前首选疗法，即打通脏层与脑池的囊壁，使囊液与周围的脑脊液交通而流出，使囊肿缩小。