根管治疗失败最主要的症状是疼痛，其疼痛是剧烈性的疼痛，多由于遗漏根管、牙髓失活不全造成的。疼痛在根管治疗之后几个月到两年内出现，属于长期的肿胀不适，无法咬硬物的疼痛。
根管治疗失败是相对应的牙龈黏膜处出现红肿、压痛，牙龈出现增生息肉、牙龈起脓包，临床检查可见患牙有明显叩痛，拍摄X线根尖片可见根尖处有低密度骨吸收影像，是由于在根管治疗过程中炎症感染没有完全控制住，根管充填不严密或者根管预备不足造成的。由于根管治疗产生的牙根折断或者牙冠折裂，也属于根管治疗失败的并发症。