所有的腱鞘囊肿发生的原因，它的机理都还不是十分清楚，说法不一。但是，现在学术界比较公认的、比较流行的、也比较认同的一个说法，就是由于关节附近活动所导致的劳损，关节周围的韧带、肌腱等等，这些组织局部的营养不良，最后，导致形成滑膜、滑液的增生和局部的滑膜的包裹，生出腱鞘囊肿。所以，这些囊肿绝大多数都是来源于手腕部或者足背关节间隙之间所产生的，它的周围充满肌腱腱鞘一样的组织。这个说法到目前为止还是比较有科学性的。