头部的核磁和脑血管核磁虽然都是磁共振检查，都检查头部，但是它们查的目的和方法不一样。头部的核磁主要用于脑梗塞、脑肿瘤、脑出血的亚急性期、多发性硬化、帕金森病、癫痫、脑炎、脑萎缩、颅脑先天性畸形、多系统萎缩以及其他的运动性障碍性疾病。通过观察不同的信号，明确颅内的结构有没有异常、有哪些病灶，通常需要观察T1像、T2像、Flair像，必要时需要做增强核磁。
如果是脑血管病，需要做弥散像和灌注像。脑血管的核磁又称为磁共振血管成像，它主要是检查颅内的大血管有没有狭窄、动脉瘤、血管畸形、颅内静脉窦血栓形成等。如果检查有异常，可能还需要做脑血管造影检查，进一步明确诊断，制定下一步的治疗方案。