跟骨骨髓炎一般要进行手术治疗，首先要在跟骨区进行开槽引流。如果这种方法效果不佳，就要进行跟骨的外侧壁切开，彻底将根骨内的脓液去除，将病灶彻底清除。
同时还可以植入载抗生素的人工骨，跟骨的表面软组织缺损处可以采用邻近的皮瓣覆盖创面就是Ⅰ期治疗。如果污染比较严重的，可以进行VSD覆盖创面引流，待创面干净后再进行Ⅱ期的皮瓣移植治疗。
这种疾病的治疗方法较多，应就医评估，根据个体情况制定治疗方案。