目前治疗强直性脊柱炎公认的药物就是NSAIDS类药，是首选药，可以迅速缓解腰部疼痛、骶髂关节的疼痛，消除关节的肿胀和晨僵的症状。在急性期的患者应该足量、持续用药，病情缓解后可以按需使用，代表的药物包括塞来昔布、美洛昔康、双氯芬酸、洛索洛芬钠、安康信，都是可以的。
当NSAIDS类药物效果不好的时候可以选择抗肿瘤坏死因子拮抗剂，也可以使用一些缓解病情的抗风湿类药物。另外，也可以使用柳氮磺胺吡啶，它可以缓解强直性脊柱炎的关节疼痛。