牙黄的原因主要是由于牙齿的内源性和外源性染色导致的，有发育时期导致和生活习惯导致。外源性染色多为不注意口腔卫生、不认真刷牙，以及又没有定期去医院洁牙的人群，这些人的口腔卫生情况较差，牙面上会有一层黄色的软垢，牙缝间有食物残渣，牙龈附近和牙龈袋内有牙石和牙菌斑，这些脏东西附着在牙面使牙齿发黄。
还有很多喜欢抽烟、喝茶和喝咖啡的人，一旦没有及时刷牙漱口就会使黄褐色的色素沉积到牙齿表面，时间久了色素连接成片使牙齿呈现黄褐色，极度影响美观。
牙齿发黄还可能是由于牙齿的内源性着色，人随着年龄的增长牙齿会逐渐变黄，原因是年龄的增长会使牙本质逐渐沉积，使牙本质层增厚，牙本质的颜色偏黄，所以牙齿也会越来越黄。另外，由于发育时期各种因素导致的牙齿内源性染色，比如四环素牙和氟斑牙的患者，也会有牙齿发黄的现象。