肌束震颤可以通过临床表现，即患者肌肉不自主发生震颤，且跟随情绪、运动、睡眠状态波动，可初步诊断为肌束震颤。还可以结合病史、头部MRI等检查，可初步判断是否为脑部病变以及病变性质，有利于明确病因。
另外，肌肉筋挛与肌束震颤都可见肌肉不自主的运动，但前者一般为收缩运动，好发于小腿；后者以跳动、震颤为主，先发于手指，后逐渐波及四肢。可以通过肌电图检查加以区分。