孩子患有先天性心脏病，手术时机没有最佳，但要根据患者病情，比如畸形严重程度以及畸形种类选择手术最佳时期。所以，不同疾病不一样，比如房室间隔缺损，手术要看缺损大小、类型和严重程度。如果室间隔缺损，缺损比较大，8-10毫米以上，建议出生以后3-6个月完成手术，因为越早手术对于孩子的肺循环和整个心脏功能影响越小。
如果缺损比较小，五毫米以内的缺损，可以观察几岁，也许可自行闭合。对复杂畸形，比如法洛氏四联症，如果孩子比较大，来做手术已经呈现了紫绀，存在对于脏器及反生长发育的不利影响，做手术可能对孩子不能够达到完全根治的程度。所以，目前一般在半岁以前就考虑进行根治手术减少缺血发作。而且就先心病来说，早期手术技术上没有特别成熟，会担心过早的手术死亡率过高。但目前先心病治疗已经发展非常成熟，所以还是应该尽早考虑手术治疗。