甲状舌管囊肿是不能自愈的。甲状舌管囊肿是颈部最常见的先天性疾病，它的发生与甲状舌管的胚胎发育异常有关，在胚胎发育期，甲状舌管没有退化或者没有完全退化而形成甲状舌管囊肿。囊肿的大小不一，一般是没有症状的，常在体检时才能发现。囊肿呈圆形，表面光滑，边界清楚，与周围组织和皮肤没有粘连，没有压痛，质地比较软，有囊性感，可随吞咽上下运动，有些囊肿上部可摸到一条索样物，囊肿发生感染时，可迅速增大，并伴有局部的疼痛和压痛。目前甲状舌管囊肿的治疗方式只能是手术切除。