回肠末端淋巴滤泡增生通常是指受到了严重的刺激，如果没有症状可以不用特殊治疗，如果有症状可以口服整肠生、美沙拉嗪肠溶片来进行治疗。
回肠末端淋巴滤泡增生主要是由于肠道有急性炎症或慢性炎症的长期刺激导致淋巴滤泡组织增生，只需要针对原发疾病进行治疗即可，如果没有任何不适的症状，检查也没有其它异常可以定期观察，平时补充益生菌来调养胃肠的消化功能。
肠道炎症的平时预防比治疗更加重要，可以多吃好消化的食物，不要经常吃生冷、油腻、油炸、辛辣、刺激等食物，对于零食、烧烤等食物也要进行控制。