肉芽组织与肉芽肿有很大的区别，简单来说肉芽组织是人体应对创伤的一种生理反应，而肉芽肿是一组疾病的概称。具体来说，肉芽组织是指在组织损伤过程中为取代坏死的实质组织，由周围的幼稚结缔组织增生所形成的红色颗粒样柔软组织，状似肉芽。
肉芽组织的作用主要是抗感染、保护创面、填补创面以及其他组织缺损，机化或包裹坏死、血栓、炎症渗出及其他异物。肉芽肿是由巨噬细胞及其演化的细胞局限性浸润和增生，所形成的界限清楚的结节状病灶，其本质是迟发的超敏反应所致的炎症，可分为感染性肉芽肿、异物性肉芽肿、结节性肉芽肿。