霉菌感染可在医生指导下口服制霉菌素、酮康唑、伊曲康唑、左霉素或静脉注射氟康唑等，再加外用药涂抹。女性的霉菌感染以霉菌性阴道炎为主，主要症状为瘙痒、白带增多、豆腐渣样白带，治疗以口服与局部用药为主。
可以口服制霉菌素、酮康唑，也可用碱性溶液冲洗阴道后，将10-20万单位的制霉菌素片或者栓剂塞入阴道，每晚一次，10-14天为一个疗程，坚持几个疗程，避免反复发作。女性在感染上霉菌性阴道炎后，要注意清洁卫生，节制夫妻生活，必要时丈夫要同时治疗。