首先我们要来分析一下病史，如果是育龄期的妇女，有继发性的痛经，并且呈进行性的加重或者有不孕，有家族史和手术治疗史，我们就应该分析疼痛或者是痛经的发生发展和月经以及手术的关系。这些手术可能是剖宫产，也可能是人流术、输卵管通液术等；其次，通过妇科检查，如果患有盆腔子宫内膜异位症，子宫多可能因为粘连而呈后位，活动度不佳或者固定。在子宫骶韧带和后穹隆可以触及有痛性结节，这些为特征性的体征；如果是卵巢子宫内膜异位症的患者，我们在附件区可以触及子宫或者是阔韧带、盆腔粘连的囊性肿块，活动度一般较差，往往有轻度的触痛，但是囊肿一般直径小于10cm；第三，可以经过腹腔镜检查，这个是目前国际公认的内异症诊断的最佳方法。术中所见也是临床分期的重要依据，特别是轻中度的子宫内膜异位症，可疑内异症造成的不孕和慢性盆腔痛，妇科检查有盆腔痛性结节等，而B超又没有阳性发现者，有条件的患者应该把腹腔镜作为首选的确诊方法。腹腔镜也是治疗子宫内膜异位症最常用的方法。还有一些其他的检查，包括超声、CT、磁共振、血清肿瘤标记物CA125的测定等等。