子宫内膜异位症的病因是不清楚的，其组织学发生复杂，所以也不能够完全预防，但是我们仍然应该积极做好以下的防护：首先，防止经血逆流。及时发现并治疗引起经血逆流的疾病，如先天性的生殖道畸形、闭锁、狭窄和继发性的宫颈粘连、阴道狭窄等等；其次，做好药物避孕。口服避孕药的患者子宫内膜异位症的发病风险是降低的，与避孕药能够抑制排卵、促使子宫内膜萎缩等等有关。因此，对于有高发家族史者、容易带环受孕者可以选择口服避孕药来做好避孕工作，同时也对疾病发生起到预防的作用；第三，防治医源性的异位内膜种植。在月经期间避免性交及妇科检查，尽量避免多次的子宫腔手术操作，做好避孕，避免人流。