先天性心脏病，主要是由于胎儿在心脏和大血管形成过程当中，出现了缺陷而造成的先天畸形，所以在儿童期比较多见，在医院里面通常归小儿心脏科进行治疗。在小儿心脏科当中，有些医院是分小儿心脏内科、小儿心脏外科或者小儿心脏中心，通常先心病的诊断主要是通过小儿心脏内科，而先心病的手术治疗通常是心脏外科进行治疗。
也有先天性心脏病的患者在早期没有接受治疗而到达成人，成人的先天性心脏病都在心脏内科或者心脏外科进行治疗。在心脏内科也是主要进行诊断，而到心脏外科去进行手术的治疗。先天性心脏病建议早期的治疗更加的合理，由于早期的治疗，畸形完全矫正之后，患者可以达到完全痊愈，不会由于心脏的结构异常，而对于心肺功能产生不良的影响。如果先天性心脏病治疗的较晚，就可能对心脏结构和功能造成永久性的损害，而影响的患者的远期生存。