任何药物都有副作用，生长激素也是如此。注射用生长激素毕竟是外源性的，不是自身分泌的，还是会有一些副作用，比如注射部位的红肿，时常会有。
同时由于应用生长激素者过去生长速度一般都较慢，使用以后生长加速，甲状腺素的需要量随之增加，有时甲状腺素未及时调整过来，可能出现相对性的甲减，需要短期补充甲状腺素。
再就是由于生长素抑制糖的代谢，偶尔也会出现血糖稍高的情况，这两项用药期间需要定期复查。
其他还有可能出现头疼、关节痛等，程度一般都较轻，减量或停药几天就会好转，再用一段时间，逐步适应就不会很明显了，其他的严重副作用极为少见。