孕妇感染弓形虫，在妊娠早期可表现为早产、流产或者是死胎。出生以后可以出现各种先天性的畸形，包括小头畸形、脑积水、脊柱裂、无眼、小眼等，以脑部和眼部病变最多。
此外也可表现为典型的四联征，包括脉络膜视网膜炎、精神运动障碍、脑钙化灶和脑积水。在新生儿期可以出现发热、皮疹、肺炎、黄疸、肝脾肿大，以及消化道症状等临床表现。在妊娠晚期感染弓形虫，胎儿可以发育正常，但会在出生以后数月至数年后，发生弓形虫病远期并发症。