牙体牙髓科主要治疗的疾病有以下几种：
1、龋齿，龋坏的各种类型，包括咬合面龋、邻接面龋、根面龋、继发龋等都在牙体科治。
2、牙髓疾病，比如急性和慢性牙髓炎、根尖周炎，可通过根管治疗的方法治疗，根管治疗后如果采用嵌体修复，牙体科也能完成。
3、牙体硬组织缺损，比如外伤、磨耗，由于横向刷牙和咬合应力，引起的牙齿颈部楔状缺损，都可在牙体科恢复牙体形态。
4、由于牙齿隐裂导致的敏感和疼痛。
5、牙根暴露引起的对冷、热、酸、甜的敏感，有的口腔科没有专门的儿童牙科，因此儿童牙齿疾患也可以在牙体牙髓科治疗，比如儿童龋齿、乳牙牙髓炎、牙面涂氟、窝沟封闭等。