甲状腺功能减退，简称甲减，造成甲减的原因比较复杂。甲减分为原发性甲减和中枢性甲减，原发性甲减就是甲状腺本身疾病，造成的甲状腺分泌功能减退。其中自身免疫性甲状腺炎，是造成甲减的最常见原因，自身免疫性甲状腺炎包括桥本式甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎和产后甲状腺炎。甲亢碘-131治疗后也经常会发生甲减，甲状腺手术会损伤甲状腺，还有颈部放疗、亚急性甲状腺炎都可以损伤甲状腺造成甲减。碘缺乏会造成合成甲状腺素的原料不足，碘过量会抑制甲状腺，长期大量进食白菜、卷心菜、甘蓝、木薯等食物，这些食物含有一定抑制甲状腺素合成的物质，可能会造成甲减。某些药物如碳酸锂、硫脲类药物、磺胺类药物、对氨基水杨酸钠、过氯酸钾、保泰松都可能造成甲减。还有中枢性甲减，这种情况非常罕见，包括垂体肿瘤、垂体炎、垂体放疗、垂体坏死等疾病。