绝大多数的口臭都由口内卫生状况不良、牙石和细菌过多导致的，牙体和口腔黏膜的疾患，比如有龋齿、牙髓炎、智齿冠周炎、溃疡等也会造成口臭。另外，一部分人口臭是因为患有肠胃疾病、糖尿病等全身其他系统疾病造成的。
刷牙不认真彻底，没有使用牙线和牙间隙刷的习惯，并且从来没有洗过牙的人，牙面和牙缝中会有大量的软垢、牙石和牙菌斑，这些释放毒素，引起牙龈炎和牙周炎，牙龈和牙周炎最主要的症状就是刷牙出血和口腔有异味。
如果有龋齿、根尖周炎或者是智齿冠周炎，口腔内治病菌和炎性分泌物增多，从而会导致口臭，另外如果长期积食或者患有胃溃疡的人，也会因食物在胃内停留时间过久，而引发口内有腐败的味道。