坏死性筋膜炎的基本病因是由于各种细菌感染侵犯筋膜所致，对于糖尿病的患者，以及长期使用非甾体消炎药的人群，坏死性筋膜炎的发生几率和风险就会增加。另外，像吸烟、酗酒、肥胖、肿瘤，以及艾滋病毒感染的患者，都可诱发坏死性筋膜炎。
坏死性筋膜炎的感染致病菌常见的有大肠埃希菌、克雷伯氏菌、葡萄球菌、链球菌，因为细菌在通常情况下毒性较低，对健康的人群并不会引起明显的危害。但是，在糖尿病病人身上，或者免疫抑制的人群身上，一旦发生皮肤或消化道侵袭性损伤，这些细菌就会产生极强的毒性，可以诱发坏死性筋膜炎的发生。