导致儿童低血糖的原因比较多，可以分为生理性和病理性两大类。长时间不进食，摄入的葡萄糖不能满足机体需要，尤其是一些偏瘦的孩子，体内的糖原比较少，进食间隔过长，机体不能通过分解糖原调整血糖水平就容易发生生理性低血糖。
糖原贮积症、先天性甲状腺功能减退、胰岛细胞瘤则可以导致病理性低血糖，糖原贮积症是机体不能有效分解肝糖原或者肌糖原，就有可能诱发低血糖反应。甲状腺功能减退因为甲状腺素不足，会影响到机体的糖代谢，出现血糖偏低，胰岛素瘤则因为肿瘤细胞可以合成和分泌比较多的胰岛素，加速血糖的利用和转化，诱发低血糖。