甲胎蛋白通常是作为肝脏肿瘤筛查的一种检查手段，甲胎蛋白升高除了发生在原发性肝癌的患者身上，还会出现在孕妇和生殖腺胚胎瘤的女性当中，如果检查出现了甲胎蛋白升高，是轻度的升高，可以和慢性肝脏炎症或者肝硬化有关。因为当出现了肝脏炎症、肝细胞坏死之后，可能会有肝脏的细胞的再生，可以导致甲胎蛋白的升高。
但是，如果甲胎蛋白持续升高，不断上长，或者维持在一个比较高的水平，要高度怀疑有原发性肝癌，要进一步的检查，做肝脏增强CT或增强核磁来进一步的判断。