牙齿上的牙石表面粗糙，会存留细菌、软垢和食物残渣，是牙周病的局部促进因子，一旦出现需要及时清理干净。牙石一般是由牙菌斑矿化而成，和牙根表面结合的比较紧密，通过日常的刷牙、漱口很难祛除干净，需要去医院处理。
临床上通常采用超声洁治的方法祛除牙石，采用超声波的高频振荡和大量水冲刷将牙石震碎并清除干净。超声洁治仅能清除掉牙龈上部和牙周袋内浅层的牙石，对于有深牙周袋的患者，牙石位置很深并且位置很隐匿，通常还需要通过牙周刮治的办法来使这些部位的牙石清除干净。病情更严重的还需要牙周翻瓣术切开牙龈，充分暴露牙根，刮除掉牙石。