脑囊虫病症状较复杂，疾病侵犯大脑不同部位可出现不同症状。常见症状为癫痫发作，为继发性癫痫，可表现为头痛、恶心、呕吐，以及肢体瘫痪、神经衰弱、失眠、记忆力减退等症状，甚至可出现痴呆表现。

此外，脑囊虫病引起脊髓损害时，可出现脑积水、颅压增高、视物不清，甚至黑蒙、视乳头水肿等。因此，脑囊虫病临床表现较复杂，可出现多种中枢神经系统症状。