化脓性关节炎和骨髓炎有很大区别，关节炎指的是关节内感染引起的炎症，也就是化脓性细菌侵入关节腔里，在关节腔里所导致的滑膜、关节软骨、关节表面破坏，这种情况叫化脓性关节炎，而骨髓炎是细菌侵入骨骼引起的骨骼、鼓膜，以及周围软组织的发炎，部位不一样。

化脓性关节炎是在关节腔里引起的炎症，对骨骼早期没有损伤、化脓，而骨髓炎主要是骨骼所造成的化脓性炎症，在骨骺板的保护下，有关节软骨的保护下，一般不会突破关节而引起化脓性关节炎。

如果化脓性关节炎治疗不及时，或者慢性骨髓炎治疗不及时，它们之间就可以相互发生转化。如果化脓性关节炎治疗不及时，破坏关节软骨进入骨骼，最后就会进入骨髓，引起化脓性骨髓炎。

化脓性骨髓炎一旦突破软骨和骨骺板屏障，而进入关节腔，就由化脓性骨髓炎演变成化脓性关节炎。化脓性关节炎主要是化脓性细菌感染，限制在关节腔里，并没有到达骨骼。

而骨髓炎主要是在骨髓里，在骨骼里并没有到达关节腔，最大的区别就是感染、化脓的部位不一样，但对于这两种类型的疾病，治疗起来都比较棘手，都应及早治疗，及早手术，避免落下后遗症。